يُعنى القسم النسائي بالمرأة والفتاة والطفل تثقيفاً وتطويراً ورعاية، ويسعى للارتقاء بمستوى المرأة وتطوير قدراتها واستثمار طاقاتها في المشاركة الفاعلة في التنمية والمجتمع، وتقديم نموذج متميز في العمل النسائي المتنوع والمتكامل المنضبط بالضوابط الشرعية.

ويتكامل القسم النسائي مع مكاتب الهيئة الأخرى في تحقيق رسالة الهيئة وأهدافها، ويتفرع عنه أربع مكاتب نسائية متخصصة ( الدعوي، والمرأة، والفتاة، والطفل ).